Unix/Linux : informatique pour la Biologie

Résumé

Type de certification

• Formation qualifiante

Thématique

• Bio-informatique et statistiques

Composante(s)

• Biologie

Présentation

Code FC

• B138

Objectifs

Le stagiaire s’initiera au traitement de l'information en biologie par l'utilisation du système Unix/Linux. Le stagiaire sera mis en situation d'utiliser des logiciels du domaine public et universitaire développés en biologie et bio-informatique, et de les interfacer de manière professionnelle grâce aux outils Unix.

Contenu

• UNIX/Linux : le système Unix, les environnements et leurs configurations (personnalisation), les outils UNIX.
• Programmation système Unix : programmation de scripts bash, interpréteurs awk, application à l'enchaînement et à l'interfaçage de logiciels du domaine public et universitaire.
• Les expressions régulières : définition et utilisation dans le traitement de l'information biologique (awk, grep, sed). Application au traitement des entrées/sorties des logiciels.

Pour en savoir plus : http://abiens.snv.jussieu.fr/OBI/OBI1

Niveau d'études visé

• Inconnu

Effectif minimal

• 1

Effectif maximal

• 4

Public cible et prérequis

Public et prérequis

Biologistes (au sens large), chercheurs, ingénieurs ou techniciens.

Pré requis : avoir une expérience minimale du travail sur ordinateur (bureautique par exemple)

Tarifs

Tarifs

1 100 €.

Organisation/Calendrier

Organisation

4 Jours consécutifs

Calendrier

Du 11 au 14 mars 2019
Inscription obligatoire au moins 2 mois avant la session.

Durée

• 28 heures

Lieu(x)

• Campus Jussieu

Contacts/Inscription

Responsable

• Lafontaine Ingrid
• Lopez Philippe

Inscription

Contact administratif

Pôle sciences - Corinne Vidal – 01 44 27 82 82
email : formation.continue@sorbonne-universite.fr
Accueil : campus Jussieu - tour 14 - couloir 14/24 – 5e étage 4, place Jussieu - 75252 Paris cedex 05 - Métro Jussieu

Evaluation/Validation

Validation

• Attestation de fin de formation